利用知识库确定胆道癌的可操作基因和候选药物

　　

　　

　　oncotarget发表了“通过基因组转录组分析和亚洲癌症知识库评估胆道癌的可操作性”，报道有必要使用复杂的知识库研究可操作基因和候选药物，并对btc进行免疫学表征，以评估分子和免疫治疗的可操作性。

　　可操作的突变和候选药物使用最大可用的亚洲人群知识库进行注释。

　　在74例患者中注释了22个可操作基因和43个候选药物。

　　最常见的可动基因为PTEN、CDKN2A、KRAS。

　　利用KB识别可操作的基因和候选药物有助于BTC治疗药物和个性化治疗的开发。

　　日本理研综合医学中心的Hidewaki Nakagawa博士和北海道大学医学院的Satoshi Hirano博士表示:“胆道癌(BTC)或胆管癌是一种世界罕见的肿瘤，起源于胆管上皮细胞(胆管细胞)。”

　　然而，其中大多数不是“可操作”的基因或突变，只有少数可操作的基因或突变可以通过任何分子治疗或药物特异性靶向BTC。

　　欧洲肿瘤医学学会推荐基因改变，如IDH1和FGFR2融合的突变，作为BTC临床可操作性的分子靶标。

　　PD-1抑制剂派姆单抗在晚期BTC中观察到的疗效与PD-L1的ps阳性状态无关，而BTC中较高的PD-L1表达与派姆单抗的有效率相关。

　　关于癌症基因组变异的临床注释，已经开发了几个知识库，整合了来自文章和临床试验的大量基因组和临床信息数据，以确定可操作的基因和候选药物。

　　本研究旨在利用具有研究水平的基因组突变列表信息的知识库检测BTC的可操作基因或突变和候选药物，并探讨可操作基因与临床病理特征的关系。

　　Nakagawa/Hirano研究小组在他们的oncotarget研究成果中总结道:“我们使用具有基因组改变研究水平信息的知识库确定了22个可操作基因和43个BTC候选药物。我们还使用RNA-seq表征了ICIs的生物标志物。基于这些数据，利用细胞系和类器官进一步验证综合候选药物，可能有助于BTC的药物发现。”